自然人独资和个人独资企业在出资人、主体资格、责任承担、注册资本要求以及税收征缴规定等方面有所不同。
出资人不同
个人独资企业只能由自然人出资设立；一人公司既可以由自然人出资设立，也可以由法人出资设立，还可以由国家出资设立。
主体资格不同
个人独资企业属于非法人组织，不具有法人资格；一人公司作为公司的一种，属于企业法人，在公司成立时取得法人资格。
责任承担不同
个人独资企业的投资人对企业的债务承担无限责任；一人公司的投资人（股东）仅以出资额为限对公司负责，即负有限责任。
税收征缴规定不同
一人有限责任公司按照税法规定，需要缴纳企业所得税。个人独资企业不需要缴纳企业所得税，只需要缴纳个人所得税。
